酋長戰役：火與影
《帝國時代3：酋長》戰役中按照歷史，以美國曆史上的真實故事設計了易洛魁人和蘇族人的戰役，雖然仍然以布萊克家族的人物為線索，但他們的故事卻是在歷史上真實發生過或有原型的事件，相比原版戰役顯得真實了不少。而阿茲特克人的戰役在帝國時代2中已經存在，而且在《帝國時代3》原版戰役中阿茲特克也已經出現在了戰役之中，故沒有在本戰役中出現。
第一幕：火焰
故事的主人公是前作中的易洛魁人坎勇凱的侄子也就是艾米利亞的父親耐薩尼奧。美國獨立戰爭中，曾經強大而團結的易洛魁部族發生分裂，一部分幫助英軍戰鬥，另一部分則幫助美國人進行獨立戰爭。戰役中耐薩尼奧與華盛頓並肩作戰，與英國人艱苦鬥爭，參加了薩拉託加戰役、約克鎮戰役等一系列美國獨立戰爭中的著名戰役，為美國獨立立下功勛。
但是戰役卻隱瞞了一些史實：歷史上獨立戰爭中更多易洛魁人幫助英軍作戰，而華盛頓為了報復則派兵進攻易洛魁村莊，大肆燒殺搶掠，所到之處盡成焦土。耐薩尼奧這樣的人或許確實存在，但是很多人卻忘了即使美國的國父也有這樣不光彩的往事。
第一關：戰鬥之舞
第二關：營救
第三關：布里德山
第四關：穿越特拉華河
第五關：薩拉託加
第六關：佛吉峽谷
第七關：莫里森鎮戰役
第八關：約克鎮戰役
結尾：獨立戰爭
第二幕：陰影
故事的主人公是艾米利亞的兒子查伊頓。19世紀，查伊頓繼承了母親的公司，和荷姆警長一同在美國西部修建鐵路，期間和蘇族人一再發生衝突。後來美國人在蘇族的聖地黑山發現黃金，查伊頓幫助荷姆進攻蘇族人並開採黃金，但在戰爭中查伊頓逐漸認識到白人的貪婪無恥和背信棄義，最終堅決地選擇了反抗，加入蘇族部落消滅了荷姆的勢力，並在瘋馬酋長的帶領下參加歷史上著名的小大角河戰役，全殲卡斯特將軍的第七騎兵團。
蘇族人是大平原上的遊牧部落，也是人類歷史上最後一個馬背上的民族。他們為了反抗白人的侵略所做的一系列鬥爭以及小大角河戰役都是歷史上真實發生過的事件，雖然最終沒有改變被白人奴役的命運，但他們的鬥爭精神仍然值得敬佩。
第一關：博茲曼小徑
第二關：紅雲戰爭
第三關：佔領
第四關：有埋伏！
第五關：轉折點
第六關：信任
第七關：小大角河戰役
結尾：蘇族
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