第二節：羈絆
注：本節爲劇情關
佐助獨白：鳴佐二人牽手發動了“子”之術解除了無限月讀。
過去的我們是孤獨…渴望愛情…讓憎恨逐漸變強的小鬼，我們各自走上不同的道路，並且對抗，但是鳴人，你絕對不會捨棄我，而且一直願意接近我的心靈。明明就算你把憎恨發泄在我身上也不奇怪。
但是你卻稱呼我爲朋友。然後，不論我如何傷害你，你還是把我當成朋友。託你的福，我才能夠得救。
渺小的我們總是互相爭執，但是現在已經可以互相理解對方內心的痛楚。
而這件事不只是我們，獲取能套用在更廣泛的事物上。
不過，我沒辦法像你做得那麼好，畢竟這沒有那麼簡單吧。這是一種類似祈禱的感情。不過在能辦得到這件事之前，我會持續忍耐。或許被交付這件任務者…那就是我們，也就是忍者吧。
劇情：佐助本來應該是要強制入獄的人，之所能免除刑責，除了解除無限月讀的大功勞之外，就是已經成爲六代火影的卡卡西以及鳴人替佐助求情。
如今的佐助打算離開木葉村到世界各地遊歷，他想以如今的自己去看待這個忍界還有這個世界。這一趟是佐助的贖罪之旅，所以他拒絕小櫻一同跟隨，但他表示之後的旅程會與小櫻一同冒險。
鳴人把之前爲佐助保管的忍者頭帶歸還給他，佐助表示會在真正分出勝負之前先收着，隨後佐助便離開了木葉村。
旁白：那是始於創生，歷經大桐木皆無中斷之連鎖。即使成爲忍者，發展爲宗族、村鎮，戰亂依舊興盛而沒有止歇，因此…憎恨不斷擴張。於是那兩人（柱間、斑），也彼此對立並且不斷戰鬥。
但是…唯一有一名忍者，斬斷連鎖、開拓未來，結交、追隨好友，挑戰並連結好友。其意志最後包圍忍者、世界與憎恨，成爲指示新道路的指標。
在此有一部忍者窮究忍者之道的忍法帳。那麼現在正是基於忍法帳名稱的時刻，起名爲——漩渦鳴人物語。
第三節：新時代
注：本節爲劇情關
旁白：木葉飄舞之處火焰燃燒。火焰照耀着村莊，也將再次萌芽。
劇情模式已更新完畢，接下來是冒險模式的攻略部分！
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