《寶可夢傳說:阿爾宙斯》中,寶可夢可以透過對戰捕捉也可以透過直接丟球捕捉,玩家們可以躲藏在草叢中接近寶可夢直接捕捉,也可以透過和好戰的寶可夢對戰之後捕捉。不同的精靈球可以讓收服寶可夢變得更加容易。
容易逃跑的寶可夢可以透過躲藏在草叢中、巖石後面或煙彈產生的煙霧中來接近並捕捉;好戰的寶可夢則可以透過寶可夢對戰來收服。善於使用各種特殊的精靈球也會讓收服寶可夢變得更容易。