相比系列前作，口袋妖怪日月分為兩個版本尤其獨特的意義 —— 本作世界裏的時間，除了部分場景外，都與實際的時間連在一起的。
在寵物小精靈太陽裏，時間會與 3DS 主機相同，而在寵物小精靈月亮版本里， 會有12小時的時差。
即使是相同的道路，由於白晝和黑夜時出現的寶可夢不同， 通過12小時的時差便可進行截然不同的體驗。
不只是寶可夢，劇情事件亦會有所不同，因此(玩家)可享受在各自的世界中箇中的樂趣。
而即使是同一個場景，有一些大自然的面貌是隻有在太陽版或是隻有月亮版才可看見的，嘗試比較看看不同版本也是相當有趣。
當然，兩個版本還有各自獨佔的寶可夢與神獸。
太陽版本神獸名為索爾迦雷歐，屬性為超能力+鋼，特性為金屬防護，特別技能為流星閃衝，可無視對手的特性進行攻擊。
月亮版本神獸名為露奈雅拉，屬性為超能力+鬼，特性為幻影防守，特別技能為暗影之光，可無視對手的特性進行攻擊。
吞噬太陽的神獸：索爾迦雷歐 & 邀月之獸：露奈雅拉
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