《靈魂駭客2》主角身為超越人類認知的智慧體Aion分裂出的其中一人——林檎，為避免世界走向毀滅，與惡魔召喚師們互相聯手展開行動。講述的是林檎等人能否撥開世界末日背後更深的迷霧。
《真·女神轉生》系列中融入科幻世界觀創作出的熱門衍生作品《惡魔召喚師 靈魂駭客》誕生的第25個年頭。繼承了《惡魔召喚師》系列以及《靈魂駭客》的DNA，跨越四分之一個世紀，以進化的理念，描繪全新人物與科技的故事。
在不遠的未來。世界面臨着不為人知的毀滅危機。守護人類世界並超越人類認知的“Aion”分身--“林檎”與“菲格”，為了改變世界毀滅的命運，降臨到人類世界。
使用惡魔召喚師專用的道具與COMP，召喚惡魔並將敵人一掃而空!
在普通人無法看到的隱祕都市國域之中，還存在有能夠進行惡魔合體與COMP改造的設施。
在酒吧、安全屋中與同伴們進行交流，有時還能進行靈境溯尋，瞭解召喚師們的過往，加深與同伴之間的羈絆。
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