異常的讀數（UNC：求救信號）
接受途徑：遊戲第一章開始時，在烏迪納辦公室的電腦普通破解後得到。
去南船座P星雲的長蛇星系的梅特哥斯星球，降落後到地圖上的指定地點，發現中了桀斯的陷阱，用步兵戰車消滅全部敵人後任務完成。
奇怪的信息（UNC：卡爾上校）
接受途徑：
1.第一章開始後進入C-sec總部普通破解屋裏的一台電腦後得到;
2.在菲洛斯的艾克斯吉諾基地中的一台服務器上調查得到;
3.在諾維利亞“頂峯15號”反應堆2樓普通破解電腦後得到。
去獵鷹H星雲的世紀星系的普雷斯洛浦星球，來到指定點後發現地堡進不去，就先去旁邊的兵營，門口會被盤查：
a.如果背景是冷血之人，告訴他們你跟凱爾共事過，可直接去地堡;
b.用談話技巧勸服他，+2道德點，可直接去地堡;
c.談崩後破解掉大門闖入，戰鬥後穿過一樓大廳打開地堡的門鎖。注意，就算和平進入兵營，如果開槍打了裏面的任何人都會進入戰鬥狀態。
見到凱爾對話後，殺掉了他，開戰，+2道德值;7點“魅力”或9點“威嚇”可以避免凱爾的死亡，+8楷模/+9叛逆。
（如果你的背景是冷血之人，這裏會出現特別附加劇情對話）
UNC：失蹤的陸戰隊
接受途徑：得到“幽靈”的身份後，追蹤米歇爾醫生任務中貝恩斯的線索，最後去和議會塔台階旁邊操作電腦的卡霍庫上校對話。
這是一個連鎖任務，三個連續任務的第一個，去阿耳忒彌斯T星雲的斯巴達星系的艾多勒斯星球，下降後到指定地點發生Boss戰：大沙蟲。
雖説保持不斷的無規律移動和持續開火可以很簡單勝利，但是這個沙蟲有一定的腦殘概率會直接從你的車子下面鑽出來秒殺你，運氣不好就讀檔吧。勝利後調查屍體，回神堡報告。
UNC：塞伯魯斯
接受途徑：完成上一個任務後星際航行時接到卡霍庫的信息，任務自動開啟。
去航行者星雲的長江星系的賓蘇星球調查，將地圖上的幾個標明的“研究設施”全部搗毀，敵人都是生物，從戰士到狙擊手都有，實力非常強，要小心。
最後一個設施裏會發現卡霍庫的屍體，調查屍體任務結束。
UNC：冥王的看門狗
接受途徑：完成上一個任務後，此任務自動開啟。
去航行者星雲的哥倫比亞星系的尼菲龍星球，進屋子開打。全滅敵人後調查終端機得到信息，回船上打開星系圖時會有人聯絡你：
a.拒絕把資料給他，+8楷模;
b.把資料賣給他，+9叛逆星幣18000。
UNC：敵意接管
接受途徑：在C-sec警署的某個辦公室裏（奇林克辦公室隔壁）的一台電腦上，專家級破解後得到。
去和銀行附近的女人海倫娜.布萊克對話，拒絕幫她殺人+8楷模，選擇幫他殺人+2叛逆，選擇不影響任務。
然後去雙子座星雲的漢朝星系的馬維岡星球和冥王星雲的狄斯星系的克倫塞爾星球，消滅這兩個地點的犯罪團伙。
再然後去馬頭星雲的命運女神星系的阿馬蘭辛星球找海倫娜.布萊克：
a.放過她，讓她領導犯罪組織，無法搜刮她的基地，得EXP660星幣5000;
b.直接選擇逮捕的話會有戰鬥，還能搜刮她的基地，+2楷模;
c.用談話技巧説服她解散犯罪團伙，但選擇放過她，+8楷模/+9叛逆EXP880萬能膠20手雷1還能搜刮她的基地;
d.用談話技巧説服她解散犯罪團伙，並選擇逮捕她，會有戰鬥，還能搜刮她的基地，+8楷模/+9叛逆。
失蹤人口（UNC：私掠者）
接受途徑：
a.成為“幽靈”後和站在議會塔中央的加羅什對話;
b.普通破解韓山港合成體觀察公司1樓電腦後得到。
任務是要求你探聽加羅什的兄弟的訊息，如果直接答應+2楷模，先拒絕再答應+2叛逆。
去馬頭星雲的劍斯特努斯星系，先調查隱藏點MSV“王權”號，然後登錄夏雯星球，進入房子殺人放火，最後調查2樓裏面房間地上的屍體，回到神堡與加羅什對話完成任務，+2道德值。
UNC：人質
接受途徑：得到“幽靈”的身份後，乘坐神堡的電梯時聽廣播，會隨機得到這個任務。
在冥王星雲的法利塔納星系的MSV安大略號上，進入後會與6個生化異能者戰鬥，注意一旦被敵人發現就會開始倒計時，要速戰速決。進入最裏面開始談判：
a.6點“魅力”或5點“威嚇”可以順利解決問題，+8楷模/+9叛逆;
b.不用談話技巧，人質被殺死，開戰，+2道德值，EXP525星幣2240。
UNC：失蹤的觀察小隊
接受途徑：得到“幽靈”的身份後，乘坐神堡的電梯時聽廣播，會隨機得到這個任務。
前往冥王星雲的安泰星系的特雷賓星球，先去研究基地裏調查一下，從電腦裏得知避難處的存在，就在研究基地旁邊，下地道同時做好戰鬥準備，裏面有近20只“屍傀”，不要一不小心被他們的電磁脈衝自爆死。
敵人全滅後任務自動完成。
桀斯行動（UNC：桀斯入侵）
接受途徑：
a.在艾克斯吉諾基地做主線任務時專家級破解電子儀器獲得;
b.進入阿姆斯特朗星雲後自動觸發。
徹頭徹尾的打架任務，阿姆斯特朗星雲的每一個星系裏的可登陸星球都有敵人的基地，挨個毀掉就可以，如果有運兵船，直接攻擊飛船或殺兵到一定程度它就會逃走。
四個星系都完成後星雲內會出現新的格力索姆星系，進入可登陸星球全滅敵人，任務完成。
塔莉與桀斯
接受途徑：完成了支線任務“UNC：桀斯入侵”後，調查桀斯電腦後得到。
和塔莉對話：
a.拒絕把資料直接給塔莉，她表示打敗薩倫後會離開，+1叛逆，EXP1029;
b.把資料交給塔莉，+1楷模，EXP1029。
UNC：失蹤的組件
接受途徑：進入阿提卡B星雲大力神星系的愛蘭塔尼亞行星，自動發生。
到了星球表面，先去調查被桀斯擊落的探測器，會得知主要的零件被猴子偷走了，這時地圖上會標出一些猴子聚集地給你搜查。
所有野外的猴子都是沒用的，地圖上方偏右的信息點是一個地道，進入裏面在最深處的房間裏的猴子身上可以得到零件，你殺了任何猴子（包括壓死）就會+4叛逆點，不殺任務猴子的情況下調查最後猴子就+6楷模點。
（程序Bug：得到組件存檔後再讀檔，可無限調查最後一個猴子得楷模點，然後再殺任意猴子得叛逆點）
拿到零件回去的路上會被桀斯襲擊，小心應對。
UNC：失蹤的貨船
接受途徑：完成初期的三個星際任務之一後，去雙子座星雲的明朝星系的MSV沃辛頓號貨船。
進入飛船，一路上都有爆炸陷阱，調查三個地圖上的信息點後出現Boss，或者你先調查躺着的人並堅持選擇切斷維生裝置的話，Boss就會直接出現。敵人是一個異能者，用“衰減”極為有效。
隨後關閉維生裝置完成任務。
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