DISK1OPEN
主角登場後用火把桌上的燈點亮，之後船上的盜賊問是誰，這裏可以選擇主角的名字。原來主角也是船上的盜賊，寒暄之後一位龍頭人身的怪物襲來，在戰鬥時可以使用“ぬすむ”指令來偷取敵人的物品，在這裏可以從敵人身上得到“リスト”和“メイジマッシヤ-”這兩樣道具。原來那怪物不是別人，是盜賊團“タンタラス團”的頭目。之後盜賊們一起開會討論這次誘拐アレクサンドリア國王女ガ-ネット姬的作戰會議，在這裏選擇第2項。他們決定通過將要出演的歌劇來誘拐王女接下來轉到黑魔導師ビビ的情節。在村裏四處調查一下，可以得到不少怪獸卡片和道具，其中在村子下放的廣場上可以得到特殊道具，好象是一種特殊的票。之後進入村中央，在中間的屋子裏把得到的票叫給那個大塊頭。之後一直往左走，來到一條衚衕裏發生老人上梯子修理房屋的情節。(因為ビビ想看アレクサンドリア國將要出演的歌劇，而那個偷梯子的小孩可以幫助他)，之後跟着那個偷梯子的小孩，最後來到一個塔底下，在這裏可以SAVE一下。然後爬上塔頂，通過民房來到劇院頂上......(因為ビビ膽子很小，所以在過房頂時雙腿不斷髮抖...)精彩的歌劇終於開始了，主角扮演的角色和另外一位演員表演比劍。在這裏考驗玩家的反應，玩家需要根據畫面的提示輸入指令，根據輸入的準確程度，觀眾和女王有滿足度，當她們滿足度高時(大概85吧，我達到93)可以得到相應的金錢。
主角的戲演完後回後台休息，這時開始了他們誘拐王女的計劃...主角來到2樓後意外的邂逅了正打算逃離王城化裝成白魔導師的王女ガ-ネット姬......主角本能的對漂亮女孩調侃，但王女沒時間和這個傢伙糾纏，把主角撞了好幾個圈，然後飛一樣的下樓，主角立刻感到這個女孩可能就是王女ガ-ネット，於是追過去...
王女出走後，王城內一片大亂...女王下令讓隊長スタイナ-追王女ガ-ネット回來。與此同時主角繼續追着王女，當主角再次找到王女後，她表示自己就是這裏的王女，希望主角能假裝將自己誘拐帶出城去(主角想...正和我意...)，主角表面上毅然同意了王女的要求，這時搜索王女的スタイナ-追了上來，於是主角和王女一起逃走...當他們逃到演出會場時，スタイナ-也追了上來，為了不破壞演出氣氛，他們即興做出了表演，演出了歌劇最動人的一幕，演出非常成功，女王也十分滿意...這時偷看演出的ビビ被衞兵看到，拼命的跑，不小心也跑到了台上，當ビビ用火魔法威脅衞兵不要過來時，不小心燒着了在地上裝死的王女ガ-ネット......ガ-ネット大叫着跳了起來，身上白魔導師的外套掉了下來......穿幫了......
スタイナ-發現原來那個白魔導師就是王女ガ-ネット於是便追過來，主角帶着ガ-ネット跑向飛空艇，接下來BOSS戰。
當主角開着飛空艇正要飛離時，女王歇斯底里的喊要把他們用大炮打下來，飛空艇中炮後，迫降在一個神祕的樹林裏。這時モ-グリ出來介紹了本遊戲的新系統ACTIVE TIME EVENT (A.T.E)這時可以SAVE一下，之後進入“魔の森”，由於王女ガ-ネット失蹤眾人決定去森林裏尋找ガ-ネット的下落。(在這裏主角可以稍微練一下等級，並且在戰鬥中可以從敵人身上偷到不少回覆劑和復活用道具，戰鬥中同時按L1+R1可以逃跑)在森林深處進行BOSS 2連戰。注意不要攻擊王女ガ-ネット或使用全員攻擊特級否則GAME OVER，當第2次打BOSS時，可以從它身上偷到武器和防具。勝利後發生A.T.E。怪物由於不敵主角逃走，在逃走前放了大量毒氣，大家只好回飛空艇解毒......
回到飛空艇處主角探望了ビビ，出門後主角不禁回憶起和ガ-ネット邂逅的情景。第2天主角決定要去營救ガ-ネット，但受到盜賊團頭目的阻攔，看來想營救ガ-ネット不得不擊敗盜賊團頭目。接下來BOSS戰，在戰鬥中可以從盜賊團頭目身上偷取回復劑和武器アイアンソ-ド。擊敗了盜賊團頭目後，一行人再一次前往“魔の森”。(在出發前最好在飛空艇上好好探索一下，可以得到不少道具。)進入“魔の森”後再次發生A.T.E。之後可以SAVE一下，然後BOSS戰，在BOSS戰時主角被K.O，這時盜賊團一位朋友ブランク前來援助。擊敗食人花怪物後，大家被森林裏奇怪的生物襲擊，只好拼命逃走，最後ブランク為了保護主角被石化......
眾人一起離開(魔の森)，終於來到外界(魔の大陸)發生A.T.E(類似此係列的“初心者的小屋”在這裏可以瞭解本作的基本系統)之後得到“モ-グリのたてぶえ”，可以在地圖畫面按方塊召喚モ-グリ，然後可以SAVE，這時ガ-ネット正式加入，她有回覆系魔法和召喚系魔法，但目前MP不足還不能召喚。
進入冰の洞窟(地圖中間靠右)，在冰の洞窟讓ビビ把冰凍的モ-グリ解凍後發生A.T.E。後可以SAVE，並接受モ-グリ的委託，然後和BOSS戰鬥。(之前可以把洞窟裏的所有寶箱打開，其中有的寶箱需要饒路，有的需要把木頭推倒......)可以從那個大怪獸身上偷到ミスリルダガ-，其附加的特技可令偷東西命中率提高。打到BOSS後一行人走出冰の洞窟，在出洞窟之前，ガ-ネット認為自己應該換個名字，當看到主角手裏武器：匕首時感覺很特別，於是就起了個名字叫ダガ-，主角當然不會放棄這一討好女孩子的機會，連忙誇獎這個名字不錯......
眾人向西來到“物見山”，在這裏可以得到許多有關飛空艇的消息。之後來到“邊境の村ダリ”(有2個寶箱和一個地點目前進不去)，因為村子很小。四人只好在一間房間裏過夜，騎士為此還十分不滿，但ダガ-卻不以為然，就在主角和騎士鬥嘴的時候，疲勞的ビビ已經進入了夢鄉......夜裏主角隱約聽見有人唱歌......發生A.T.E之後可以SAVE一下。之後主角出門進入作側屋子遇上ダガ-，對話時選“いい感じだぜ”然後選“ウソのぅまい女と思ったけどな”，之後可以調查宿屋上方的牆，可以看到ダガ-在自言自語......在村子裏找到了ビビ。和主角談論完女孩後發生A.T.E，在村子和其他人交談後回到宿屋和ダガ-對話發生A.T.E，然後主角與ダガ-一起去找ビビ和スタイナ-。
走出宿屋向村北走，發現原來ビビ為了找陸行鳥被困在地下，於是兩人開始找進入底下的方法，在村子上方，調查磨房旁邊的井蓋，下去後發現ビビ被人劫持，主角剛要上去救人，ダガ-趕忙制止説看清楚情況在動手.....兩人再次進入劫持ビビ的地區，(在這裏通過一些機關，可以得到一些道具)。最後在一個木箱裏找到了ビビ，主角告訴ビビ以後要有勇氣，如果再有人欺負自己的話就大聲罵“你這混蛋!”......同時在這間屋子裏發現了一台奇怪的機器--好象是把奇怪的煙變成蛋狀的東西...繼續前進發現這機器的動力居然是陸行鳥,而且看到那些蛋最後變成了黑魔導師......
故事轉到スタイナ-這裏，當主角們從木桶裏出來時，嚇了スタイナ-一跳，不過他馬上就指責主角説他和王女之間應該注意身份...之後進行BOSS戰，(這次的敵人是之前在冰の洞窟裏BOSS的強化版-黑のワルツ2號)戰鬥中可以從BOSS身上偷到とんがり帽子和レザ-プレイト。勝利後主角們乘空飛艇向リンドブルム出發，但在途中遇到BOSS“黑のワルツ3號”的襲擊，經過一番激烈的戰鬥後，不但擊敗了“黑のワルツ3號”而且還漂亮的躲開了追擊。在和“黑のワルツ3號”的戰鬥中可以偷到“エスカッション”、“とんがり帽子”、“リネンキュラッサ”
終於進入リンドブルム城，這個城堡好大，先好好的逛逛，最後乘電梯來到了シド前面，但這個城堡的主人シド被人襲擊並且變成了ブリ蟲的樣子了。與此同時，主角在酒館遇見了三年不見的フライヤ......ダガ-和シド談完話之後發生A.T.E。
畫面轉到主角一人行動，出屋後發生幾段A.T.E，在這做城成裏共分為商業區，劇場街，工廠區リンドブルム城(王城宿屋有方有衞兵看守進不去)。先在商業區逛逛，採購和合成一些武器/防具(最近這裏比較流行卡片遊戲，可以和他們進行對戰，方法是按方塊鍵和他們對話。)然後主角坐飛空艇來到劇場街，進入鐘樓發生A.T.E，出鐘樓後再次發生A.T.E。繼續向下走來到一俱樂部，在這裏許多女孩在等一位名星，這時從裏面走出一個巨大的モ-グリ......回到鐘樓上面的小屋，發現剛才的歌星也在，和他對話得到特殊道具“明星的歌”，仔細調查一下週圍，還能得到其他道具。完成事件後回到飛空艇處返回商業區。接下來去工廠區，在這裏的酒館和其他地區可以得到一些有關新飛空艇的情報，而且仔細調查道路兩旁還可以得到一些防具。(其中有一件防具的附加屬性可以防止石化。)最後來到リンドブルム城，在宿屋遇到スタイナ-，説是去找ダガ-自己一個人走了。主角走出宿屋，聽見ダガ-在唱歌，於是想上樓去見ダガ-，不過守門的士兵不讓主角過去，於是主角騙宿屋下放的士兵説大事不好了，並把他騙到宿屋打昏，於是換上士兵的服裝......主角上樓後看到ダガ-並誇獎她的歌非常優美。
狩獵祭開始後主角去劇場街，在12分鐘內得分的一方獲勝，勝利後可以獲得各式各樣的獎品。(其中主角在劇場街打完怪獸後來到工廠區，走右邊的岔路可以打一個BOSS級怪物，這時主角的好友フライヤ來助陣。擊敗他肯定能贏這場狩獵祭，另外可以從他身上偷到2個好防具。)狩獵祭後，主角受到嘉獎和榮譽稱號。就在這時，臨國的士兵來求助，自己的國家被黑魔導師軍團(ダガ-母親所管轄)襲擊。同時這也是フライヤ所在的國家，於是主角決定幫助フライヤ，雖然ダガ-也想去，希望可以説服母親，但被主角拒絕。在宴會上ダガ-用催眠藥使將大家葷睡，ダガ-決定自己的事情自己解決，於是和スタイナ-一起出發....
眾人醒來後發現スタイナ-和ダガ-不見，主角認為她們一定自做主張去冒險了，於是立即出發。於是一行人向ブルメシア出發，先來到“ギザマル-クの洞窟”。(不過在此之前可以先去一下“チョクボの森”，收集陸行鳥的情報。去“ク族の沼”收集ク族的情報。)在“ギザマル-クの洞窟”裏需要用一些“鈴”開啟不同的門，在一大鐘處主角幫助モ-グリ把它新婚的愛人救出來(需要“クポの實”，這是一種モ-グリ非常喜歡的東西，之前可以探索得到)，之後可以和兩位モ-グリ對話，在要離開的時候一個モ-グリ為了感謝主角將最後的“鈴”交給主角。拿着“鈴”可以先SAVE一下，然後BOSS戰。戰鬥中可以獲得3種道具：エリクサ-(HP/MP全回覆)，冰のつえ(一個冰杖，可以使用2級冰魔法)和三角帽子。
故事轉到スタイナ-和ダガ-，他們來到南ゲ-ト邊境，瞭解情況後，從這裏的士兵處得到ゲ-トパス(通行證)，在這附近調查可以得到ダガ-用的武器。離開前，ダガ-從スタイナ-的包袱裏出來，告訴スタイナ-從這裏開始，説話時不要敬禮，這樣會被別人認出來。在這裏可以先SAVE一下，順便接受モ-グリ的委託，兩人出示了通行證坐上列車，這時スタイナ-非常自然的稱呼ガ-ネット姬。ダガ-立刻告訴スタイナ-以後不要這樣稱呼......(和主角相處的這段日子已經淡忘了那些宮廷規矩...)故事轉回主線，主角一行人通過ギザマル-クの洞窟來到ブルメシア，看着滿目創痍的ブルメシア，フライヤ非常憤怒......3人在城市裏可以找到不少道具(注：在從右側上2樓後需要走過樓梯，如果跑的話會使樓梯斷裂從而無法得到寶箱)，當遇到一扇門不能進入時，需要下樓，然後從左側的門進入在2層的一張牀周圍調查得到道具。再次回到那扇門處，進去後フライヤ遇到了王城裏的朋友，朋友勸フライヤ趕緊離開，現在王城裏面非常危險......眾人繼續前進，在進入大堂之前先進入左右兩個屋子，可以得到フライヤ專用武器，並可以在右側屋子購買物品、SAVE、接受モ-グリ委託。最後進入大堂戰，(有百人斬稱號的女將軍ベアトリクス)可以從她身上偷到“ミスリルソ-ド”、“チェインプレイト”、“バルピュタ-”這3樣道具一段美麗的CG後......
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