7：機器中的幽魂（Ghost in the Machine）
在飛船找坎齊，她要在虛擬世界裏植入自己的智能程序，現在主角得在虛擬世界裏找到一具寄宿的軀體。在外星人的熱點裏有一隻CID（類似指揮系統的機器人），如果刪除掉它原有的程序，坎齊所寫的人工智能就可以借用它的軀殼。
趕到此前佔領過的熱點，清除外星士兵，跑到武器箱拿反彈槍，這種槍的子彈打到金屬表面會彈跳。清完敵人上前啟動一隻CID，帶着它前往附近的屋頂，坎齊連線調查它。此時要保護一段時間，外星人會乘着飛行器趕到，蹲到建築後將他們一一擊落。堅守1分多鐘，空中出現一艘戰艦，此時要躲避它的範圍轟擊。
坎齊説要用55分鐘來升級CID的程序，主角於是帶着它趕往靠近發電站的節點以提升下載速度。建議召喚一架UFO前往，後面的防守會用得到。在途中聊到等完成AI植入後先救那名隊員，主角表示該先救馬特·米勒，這讓死對頭的坎齊很不舒服，大叫為何如此。主角解釋説馬特已經改變了生活的方向，他加入MI6，幫助聖徒攻擊了塞勒斯的部隊，眼下正是這場虛擬世界網絡大戰的關鍵時刻，聖徒需要更多的援手，兩個腦袋總比一個要強。
來到節點，用UFO的導彈清掃一下敵兵，跑過去啟動下載，顯示需要16分鐘。返回到UFO進行防守，這裏用導彈清理兩側出現的外星車輛，要注意的是不能離CID過遠，時間久了任務會失敗;注意導彈落點和CID的距離，不要誤傷到它。
守到1分鐘的時候，坎齊發現附近有兩個節點，啟動它們可以增加帶寬，提升下載速度。將兩處節點啟動後，坎齊説CID由於數據傳輸太快而過熱，迅速返回用“凍結”技能為它降温。接下來要防守3分鐘的時間，建議回到UFO上去，除了兩側的外星車輛和殺手機器人，空中還有幾架戰機。
下載完成離開UFO，接下來是與典獄官的對決，和此前一樣，用“火焰”或“凍結”技能來破壞他的護盾，再開槍打他的軀體。將他擊殺後，解鎖心靈控制技能“隔空移物”。
進入訓練場學習一下隔空移物的運用，用此技能可以拋擲人或物體，拋擲汽車來打典獄官是比較有效率的，並且那些藏在球體裏的數據簇也可以拿到了。
接下來要玩一個“意念謀殺”的小遊戲，目的是熟悉一下新學的“隔空移物”技能。在空中浮有四種圈圈，每個圈標識着需要投進去的物品種類，車輛扔到藍色圈裏，人類扔到綠色圈裏，傑奇教授娃娃扔到粉色圈裏。扔完三個地點的圈圈即告完成，解鎖新型的意念謀殺（M.O.M.）小遊戲，完成後解鎖城南的一道傳送門。
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