導讀：此處省略了“線上對戰模式”詳解
忍者世界錦標賽模式
忍者世界錦標賽模式主要分為了兩個部分，一是錦標賽事件，一是支線事件。
錦標賽事件也就是過關斬將，最終獲得忍者世界錦標賽的冠軍。而支線事件多為伴隨錦標賽事件而發生。
譬如錦標賽事件要求玩家隊伍之中湊夠一定數目的成員，就得去完成支線事件。
錦標賽賽制非常簡單，玩家最多可以選擇5名角色參加，一個賽事一共有4支隊伍參加，每場賽事是四人大混戰，採取積分淘汰制。
5名角色分別參加一個回合的賽事，一場賽事共五回合，上場完結後所獲得的積分會累計到下一名角色的賬户上。
獲得積分的辦法就是擊中對手、瞭解對手和盜取別人跌落到地面的積分球（呈現橙色）。
在最終回合完結之後，積分最多的隊伍進獲得進入下一輪賽事的資格。
注：錦標賽當中對終極忍術的使用會有限制
要進入下一輪錦標賽，就必須要滿足指定條件，也就是需要完成錦標賽支線事件。這些支線事件多為招募同伴的任務，去尋找那些頭頂上有紅色拉手的NPC，向他們領取任務。
這些任務包括了回答火影動漫相關問題、尋人（尋物）、對戰等極具RPG元素的內容。
打開支線事件詳情，可以瞭解任務的來龍去脈，如果想要更加具體的提示，必須要找到領取任務的人，與之對話，在對話框中會出現一些紅色字體，那就是任務的關鍵（有助玩家完成任務）。
機械鳴人模式
忍者世界錦標賽模式完成Drank之後，在選擇遊戲模式的忍者世界錦標賽模式之中就會出現機械鳴人模式。
這個模式更加接近與《究極忍者風暴：世代》，更加強調《機械鳴人》劇場版的劇情內容，RPG味道也相當濃厚。
在機械鳴人模式當中，玩家只能夠扮演漩渦鳴人，而不能像錦標賽模式之中隨意選擇操作的角色。
同樣也可以在場景中自由行動，蒐集或購買忍具。
忍者劇場模式
忍者劇場分為了三個故事，每個故事與動漫一致，而且內容都是動畫播放再加插一場戰鬥的模式。
其戰鬥模式與單人戰鬥、團隊戰鬥一致。
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