主線：黑旗行動-押送囚犯
注：在進行此任務將無法執行支線任務，請在此任務前完成所有支線。
劇情：戰略指揮部已經批准了雷耶斯在日內瓦實施行動的提議。按照雷耶斯的計劃，囚犯將會被亞鬆到UNSA總部。醫療隊會從他體內將發信器移除。隨後該裝置將被焚燬。
懲戒號返回到地球，市區人羣已經被疏散，可是echo車隊已經遭到敵人襲擊，而且瑞亞已經被救走。
step1.前往echo的囚車，發現只剩下一名少校，俘虜已經逃走了。
走出橋洞，外出探頭要小心上方的敵人。
穿過一座建築物的小園，會遭到埋伏。
step2.走到街上需要進入到左側的自行車店鋪內，這時候內進要當心大街上後續補充的敵人。
除掉所有敵人後才打開自行車店鋪裏面的門。
step3.進入到一個二層建築物內，最好使用蜘蛛機械人去尋找敵人，因為他們有不少都是蹲在角落當中。
去到建築物的三層可以對遠處房頂的狙擊手進行還擊。
step4.來到教堂外圍，這裏會進行較漫長的戰鬥，在消防車處可以拿到彈藥補給。
當雷耶斯走到教堂門前會出現兩名敵人，可以朝該門投擲炸彈。
step5.從教堂外的建築架登上二層窗户進入到教堂內，朝裏面扎堆的敵人投擲手雷。
然後清理教堂內各層的敵人，在頂樓處就可以逮住瑞亞，可是他居然剖腹取出發信器並且摧毀它，這時候奧林匹斯山號出現在日內瓦的上空，並且摧毀了瑞恩斯所在的總部！
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